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文檔簡介

201980077649.42019.09.25提供了DLL3結合蛋白和靶向DLL3的多特異性蛋蛋白、DLL3靶向三特異性蛋白預防和/或治療疾23.根據權利要求1或2所述的DLL3靶向三特異性蛋白,其中所述第三結構域(C)包含親4.根據權利要求3所述的DLL3靶向三特異性蛋白,其中所述親和力成熟的結合分子衍5.根據權利要求3或4所述的DLL3靶向三特異性在親和力成熟輪次后衍生自與DLL3特異性6.根據權利要求5所述的DLL3靶向三特異性蛋白,其中所述親和力成熟輪次包括針對7.根據權利要求6所述的DLL3靶向三特異性蛋白,其中所述噬菌體展示文庫是通過使8.根據權利要求7所述的DLL3靶向三特異性蛋白,其中所述噬菌體展示文庫表達衍生9.根據權利要求8所述的DLL3靶向三特異性蛋白,其中所述親和力成熟的結合分子選DLL3結合分子對所述DLL3蛋白的結合親和力大于所述親本分子對所述DLL3蛋白的結合親3提交的第62/736,358號美國臨時申請和2019年7月22日提交的第62/877,227號美國臨時申本文。創建于2019年9月25日的所述ASCII副本被命名為47517一733_601_SL.txt,大小為[0007]仍然需要用于治療與DLL3過表達有關的腫瘤性疾病如神經內分泌腫瘤的其他可[0008]一個實施方案提供了一種DLL3靶向三特異性蛋白,其中所述蛋白包含(a)第一結H2N(C)(A)(B)COOH的順序連接,或通過連接體L1和L2,以H2N(A)L1(B)L2(C)4施方案中,所述第三結構域(C)包含CDR1、CDR2和CDR3,其中所述CDR1包含選自SEQIDNo.368_442的序列至少80%相同的序列。[0011]一個實施方案提供了一種DLL3靶向三特異性蛋白,其中所述蛋白包含(a)第一結5同或相對于該序列包含一個或多個氨基酸殘基置換;r2是CDR2,并且與選自SEQIDNo.8851326和1888的序列相同或相對于該序列包含一個或多個氨基酸殘基置換;且r3是[0046]一個實施方案提供了一種DLL3靶向三特異性蛋白,其中所述蛋白包含(a)能與人6述DLL3蛋白的結合親和力。在一些實施方案中,所述親和力成熟的DLL3結合分子對所述DLL3蛋白的結合親和力是所述親本分子對所述DLL3蛋白的結合親和力的約2倍至約50倍。述第三結構域(C)包含與選自SEQID1888的序列的一個或多個氨基酸置換。在一些實施方案中,所述CDR3包含選自SEQID選自SEQIDNo.1379_1412的序列的一個或多個氨基酸置實施方案中,所述CDR3包含選自SEQIDNo.1379_1412的序列,或相對于選自SEQID一個或多個氨基酸置換。在一些實施方案中,所述第三結構域(C)包含與選自SEQIDNo.368_442的序列至少約75%相同的序列。[0049]一個實施方案提供了一種DLL3靶向三特異性蛋白,其中所述蛋白包含(a)能與人76為[0083]一個實施方案提供了一種DLL3靶向三特異性蛋白,其中所述蛋白包含(a)能與人8些實施方案中,所述第三結構域(C)包含與DLL3特異性結合的單結構域抗體、VHH結構域、9[0113]在一些實施方案中,所述第一結構域(A)包含與CD3特異性結合的單結構域抗體、包含一個或多個氨基酸殘基置換;且r3與選自SEQIDNo.1327_1768和1889的序列相同或方案中,連接體L1和L2各自獨立地為(GGGGS)4(SEQIDNo.1817)或(GGGGS)3(SEQID[0116]一個實施方案提供了一種藥物組合物,其包含(i)根據上述實施方案中任一項所述的DLL3靶向三特異性蛋白或根據本公開的DLL3結合蛋白,和(ii)藥學上可接受的載體。一個實施方案提供了一種制備根據上述實施方案中任一項所述的DLL3靶向三特異性結合DLL3結合蛋白;以及(iv)使用步驟(iii)中鑒定的DLL3結合蛋白制備DLL3靶向三特異性蛋[0117]一個實施方案提供了一種產生根據上述實施方案中任一項所述的DLL3靶向三特同或相對于該序列包含一個或多個氨基酸殘基置換;r2是CDR2,并且與選自SEQIDNo.885_1326和1888的序列相同或相對于該序列包含一個或多個氨基酸殘基置換;且r3是CDR3,并且與選自SEQIDNo.1327_1768和1889的序列相同或相對于該序列包含一個或多蛋白包含與選自SEQIDNo.1_442和1886實施方案中,所述DLL3結合蛋白包含與選自SEQ列。在一些實施方案中,所述DLL3結合蛋白包含與選自SEQIDNo.87_367的序列至少約序列至少約75%相同的序列。一個實施方案提供了一種DLL3結合蛋白,其衍生自包含SEQ[0121]一個實施方案提供了一種制備根據本公開的DLL3結用包含含有選自SEQIDNo.1_442和1886的序列的DLL3結合域的DLL3靶向三特異性蛋白,靶向三特異性蛋白或DLL3結合蛋白選擇性地結合表達DLL3的腫瘤細胞。在一些實施方案用包含SEQIDNo.68或75所示序列的DLL3結合域,或包含SEQIDNo.68或75所示序列的[0126]在一個實施方案中提供了一種DLL3結合蛋白,其包含SEQIDNo.1890或SEQIDNo.1891所示的氨基酸序列。[0127]一個實施方案提供了一種DLL3靶向三特異性蛋白,其中所述蛋白包含(a)第一結對所述DLL3蛋白的結合親和力是所述親本分子對所述DLL3蛋白的結合親和力的約2倍至約[0130]在一些實施方案中,所述第三結構域(C)包含選自SEQIDNo.1_442和1886的序方案中,所述第三結構域(C)包含CDR1、CDR2和CDR3,其中所述CDR1包含選自SEQID[0131]在一些實施方案中,所述第三結構域(C)包含CDR1、CDR2和CDR3,并且其中所述案中,所述第三結構域(C)包含CDR1、CDR2和CDR3,并且其中所述CDR1包含選自SEQID構域(A)包含選自SEQIDNo.1793_1807和1897_1898的序列。案中,所述結構域以H2N_(A)_(B)_(C)_COOH的順序或通過連接體L1和L2以H2N_(A)_L1_(B)_L2_(C)_COOH的順序連接。在一些實施方案中,連接體L1和L2獨立地包含GGGGSGGGS(SEQIDNo.1808)的序列。在一些實施方案中,所述DLL3靶向三特異性蛋白包含SEQIDNo.1890或SEQIDNo.1891的序列。[0133]一個實施方案提供了一種DLL3靶向三特異性蛋白,其中所述蛋白包含(a)第一結SEQIDNo.75。在一些實施方案中,所述第三結構域(C)包含同或相對于該序列包含一個或多個氨基酸殘基置換;r2是CDR2,并且與選自SEQIDNo.885_1326和1888的序列相同或相對于該序列包含一個或多個氨基酸殘基置換;且r3是CDR3,并且與選自SEQIDNo.1327_1768和1889的序列相同或相對于該序列包含一個或多[0137]一個實施方案提供了一種DLL3靶向三特異性蛋白,其中所述蛋白包含(a)第一結具有SEQIDNo.1316的氨基酸序列的CDR2和具有SEQIDNo.1758的氨基酸[0138]一個實施方案提供了一種DLL3靶向三特異性蛋白,其中所述蛋白包含(a)第一結H2N(C)(A)(B)COOH的順序連接,或通過連接體L1和L2,以H2N(A)L1(B)L2(C)(C)(B)(A)COOH的順序或通過連接體L1和L2以H2N(C)L1(B)L2(A)COOH的順序連接。在一些實施方案中,所述第三結構域(C)是親和力成熟的結合分子,其衍生自與所述述親本分子包含SEQIDNo.68或SEQIDNo.75的氨基酸序列。[0145]一個實施方案提供了一種DLL3結合蛋白,其包含具有選自SEQIDNo.851、867、[0152]圖3示出了使用包含本公開的示例性DLL3結合域DH2、DH43、DH10和DH6的示例性[0155]圖6示出了使用包含本公開的示例性DLL3結合域DH58和DH70的示例性DLL3靶向三[0160]圖11示出了使用包含本公開的示例性DLL3結合域3H06和4B011以及親本DLL結合域DH43、DH6的示例性親和力成熟的DLL3靶向三特異性蛋白,以及對照三特異性蛋白,對[0162]圖13示出了使用包含本公開的示例性DLL3結合域1A011(在圖13上標記為1A11)、[0164]圖15示出了使用包含親本示例性DLL3結合域DH43和DH6的示例性純化的DLL3靶向[0165]圖16示出了使用來自第二輪親和力成熟的包含本公開的示例性DLL3結合域的示[0166]圖17示出了每個泳道加載2.4微克非還原蛋白質并用考馬斯染色的10_20%TRIS達的DLL3靶向三特異性蛋白,以及靶向GFP的對照結合三特異性蛋白,對DMS_153細胞的抗CD3:抗ALB:抗DLL3(CAT)構型或抗DLL3:抗ALB:抗CD3(TAC)構型包含本公開的DLL3結合域52D04的示例性DLL3三特異性蛋白,對NCI_H2171細胞抗ALB:抗DLL3(CAT)構型或抗DLL3:抗ALB:抗CD3(TAC)構型包含本公開的DLL3結合域52D04的示例性DLL3靶向三特異性蛋白,對DMS_79細胞的T細胞依賴性細胞毒性(TDCC)測定的結抗CD3:抗ALB:抗DLL3(CAT)構型或抗DLL3:抗ALB:抗CD3(TAC)構型包含本公開的DLL3結合域52D04的示例性DLL3三特異性蛋白,對SHP77細胞的T細胞依賴性細胞毒性(TDCC)測定的抗CD3:抗ALB:抗DLL3(CAT)構型或抗DLL3:抗ALB:抗CD3(TAC)構型包含本公開的DLL3結合[0175]圖26描繪了與僅含第二抗體的對照或沒有任何抗體或三以抗DLL3:抗ALB:抗CD3(TAC)構型包含本公開的DLL3結合域52D04的示例性DLL3靶向三特[0176]圖27描繪了與僅含第二抗體的對照或沒有任何抗體或三以抗CD3:抗ALB:抗DLL3(CAT)構型包含本公開的DLL3結合域52D04的示例性DLL3靶向三特構型包含本公開的DLL3結合域52D04的示例性DLL3靶向三特異性蛋白與表達人DLL3的細胞構型包含本公開的DLL3結合域52D04的示例性DLL3靶向三特異性蛋白與表達人DLL3的細胞[0187]圖38示出了在與NCI_H82細胞共培養的T細胞上CD69表達其中滴定了以抗DLL3:抗ALB:抗CD3(TAC)構型包含本公開的DLL3結合域52D04的示例性[0188]圖39示出了在與NCI_H82細胞共培養的T細胞上CD25表達其中滴定了以抗DLL3:抗ALB:抗CD3(TAC)構型包含本公開的DLL3結合域52D04的示例性中滴定了以抗DLL3:抗ALB:抗CD3(TAC)構型包含本公開的DLL3結合域52D04的示例性DLL3中滴定了以抗DLL3:抗ALB:抗CD3(TAC)構型包含本公開的DLL3結合域52D04的示例性DLL3[0191]圖42示出了在與NCI_H82細胞共培養的T細胞上CD69表達其中滴定了以抗CD3:抗ALB:抗DLL3(CAT)構型包含本公開的DLL3結合域52D04的示例性[0192]圖43示出了在與NCI_H82細胞共培養的T細胞上CD25表達其中滴定了以抗CD3:抗ALB:抗DLL3(CAT)構型包含本公開的DLL3結合域52D04的示例性中滴定了以抗CD3:抗ALB:抗DLL3(CAT)構型包含本公開的DLL3結合域52D04的示例性DLL3中滴定了以抗CD3:抗ALB:抗DLL3(CAT)構型包含本公開的DLL3結合域52D04的示例性DLL3[0195]圖46示出了T細胞和NCI_H82細胞的共培養物在條件培養基中的IFNγ測量的結[0196]圖47示出了T細胞和SHP77細胞的共培養物在條件培養基中的IFNγ測量的結果,所述細胞與滴定的以抗DLL3:抗ALB:抗CD3(TAC)構型包含本公開的DLL3結合域52D04的示[0197]圖48示出了T細胞和NCI_H82細胞的共培養物在條件培養基中所述細胞與滴定的以抗DLL3:抗ALB:抗CD3(TAC)構型包含本公開的DLL3結合域52D04的示述細胞與滴定的以抗DLL3:抗ALB:抗CD3(TAC)構型包含本公開的DLL3結合域52D04的示例[0199]圖50示出了T細胞和NCI_H82細胞的共培養物在所述細胞與滴定的以抗DLL3:抗ALB:抗CD3(TAC)構型包含本公開的DLL3結合域52D04的示述細胞與滴定的以抗DLL3:抗ALB:抗CD3(TAC)構型包含本公開的DLL3結合域52D04的示例[0201]圖52示出了T細胞和NCI_H82細胞的共培養物在條件培養基中的IFNγ測量的結[0202]圖53示出了T細胞和SHP77細胞的共培養物在條件培養基中的IFNγ測量的結果,所述細胞與滴定的以抗CD3:抗ALB:抗DLL3(CAT)構型包含本公開的DLL3結合域52D04的示[0203]圖54示出了T細胞和NCI_H82細胞的共培養物在條件培養基中所述細胞與滴定的以抗CD3:抗ALB:抗DLL3(CAT)構型包含本公開的DLL3結合域52D04的示述細胞與滴定的以抗CD3:抗ALB:抗DLL3(CAT)構型包含本公開的DLL3結合域52D04的示例[0205]圖56示出了T細胞和NCI_H82細胞的共培養物在所述細胞與滴定的以抗CD3:抗ALB:抗DLL3(CAT)構型包含本公開的DLL3結合域52D04的示述細胞與滴定的以抗CD3:抗ALB:抗DLL3(CAT)構型包含本公開的DLL3結合域52D04的示例[0207]圖58描繪了在注射人T細胞與NCI_H82小細胞肺癌細胞混合物的小鼠中,在20μg/(CAT)構型包含本公開的DLL3結合域52D04的示例性DLL3靶向三特異性蛋白能夠抑制腫瘤ALB:抗DLL3(CAT)構型包含本公開的DLL3結合域52D04的示例性DLL3靶向三特異性蛋白能[0209]圖60描繪了在注射人T細胞與SHP77小細胞肺癌細胞混合物的小鼠中,在10μg/kg[0210]圖61描繪了以抗CD3:抗ALB:抗DLL3(CAT)構型(ID編號1和2)或抗DLL3:抗ALB:抗CD3(TAC)構型(ID編號3和4)包含本公開的DLL3結合域52D04的示例性DLL3靶向三特異性蛋[0211]圖62描繪了以抗CD3:抗ALB:抗DLL3(CAT)構型包含本公開的DLL3結合域52D04的示例性DLL3靶向三特異性蛋白的藥代動力學譜。圖中顯示了在以1mg/kg或10mg/kg注射到[0212]圖63描繪了在本公開的示例性DLL3結合TriTAC分子以1mg/kg和10mg/kg劑量或媒[0213]圖64示出了對DMS53細胞進行的TDCC測定的結果,其中使用以抗CD3:抗ALB:抗融化的蛋白質,或使用在給予10mg/kgDLL3靶向三特異性蛋白質后168小時采集的食蟹猴種預防和/或治療疾病、病況和病癥的方法。所述DLL3靶向三特異性蛋白能夠特異性結合持在一起的兩條重(H)多肽鏈和兩條輕(L)多肽鏈。人輕鏈包含可變域(VL)和恒定域(CL),柔性鉸鏈區隔開,該柔性鉸鏈區是可變長度(在IgG含脯氨酸和半胱氨酸的區段。輕鏈和重鏈中的可變域都通過約12個或更多個氨基酸的“J”有助于Fab運動的結構柔性。IgG1的輕鏈和重鏈之間的鏈間二硫鍵在?或λ輕鏈的C214與重鏈上鉸鏈區中的C220之間形成。重鏈之間的鏈間二硫鍵位于位置C226和C229處(全部按照體、人源化和靈長類動物化抗體、CDR移植的抗體、人抗體、重組產生的抗體,胞內抗體包含重鏈可變域的重組蛋白。在一些實施方案中,該VHH來源于選自駱駝、美洲駝、駱馬中,該VHH來源于羊駝(例如但不限于霍加耶羊駝(HuacayaAlpaca)或蘇里羊駝(Suri過FR區緊密靠近保持在一起,并且與來自另一條鏈的CDR一起有助于形成抗體的抗原結合位點(參見Kabat等人,SequencesofProteinsofImmunologicalInterest,第五版,況下通過遺傳工程獲得的scFv片段(對于單鏈片段可變)在單個多肽鏈中締合抗體的VH和CDR是根據以下提供的編號方案之一:Kabat等人(1991)SequencesofProteinsofImmunologicalInterest(第5版),USDept.ofHealthandHumanServices,PHS,NIH,NIH2687698;MacCallum等人,1996,PMID:8876650;或Dubel,Ed.(2007)HandbookofTherapeuticAntibodies,第3版,Wily_VCHVerlagGmbHandCoorAbM(OxfordVHH結構域,并且包含三個CDR。在一些實施方案中,這類僅重鏈的抗體以單體形式結合是指在Kabat等人,SequencesofProteinsofImmunologicalInterest,第五版PublicHealthService,NationalInstitutesofHealth,Bethesda,Md.(1991)中用于抗體編譯變域可包含在H2的殘基52之后的單氨基酸插入(根據Kabat為殘基52a)和在重鏈FR殘基82PharmaceuticalBasisofTherapeutics21_25(AlfredGoodmanGilman、Louis度通常并未接近消除過程的飽和所需的濃度。指數過程的速率可由其速率常數k或由其半定分數的藥物,因此藥物濃度的對數相對于時兩種或更多種蛋白質對單一結合靶標具有相當的結合親和力,那么各蛋白質與所述單一結合靶標結合的Kd值在彼此的±2倍之內。如果表明蛋白質以相當的結合親和力結合兩種或3000(BIAcore,Inc.,Piscataway,N.J.)通過放射性標記的抗原結合測定(RIA)或表面等離 的實施方案中,使用OCTET退Systems(PallLifeScien化的人或食蟹猴DLL3)固定在OCTETg鏈霉親和素毛細管傳感器端頭表面上,然后按照白的測定緩沖液的情況下觀察到完全解離。然后使用適當的工具例如ForteBio軟件來確定結合反應的動力學參數。[0227]一個實施方案提供了一種DLL3結合蛋白(本文也稱為DLL3結合域,如本公開的DLL3三特異性抗體的DLL3結合域),其包含單結構域抗體,該單結構域抗體含有包含選自三特異性蛋白或DLL3TriTACTM)包含(a)與人CD3特異性結合的第一結構域(A);(b)第二結COOH的結COOH的COOH(A)COOH的結構域順序。在一些實施方案中,所述DLL3靶向三特異性蛋白具有H2N(C)[0237]在一些實施方案中,所述三特異性結合蛋白包含特異性結合肽篩選數百萬種多肽。多價噬菌體展示方法已用于通過與絲狀噬菌體的基因III或基因選擇是基于固有的配體親和力,并且使用了噬菌粒載體,從而簡化了DNA操作。Lowman和變化的洗滌時間來從預候選DLL3分子中鑒定具有增加或減少的解離速率的DLL3結合分子。DLL3結合親本分子對其具有特異性的或被設計為對其具有特異性的DLL3表位。關于后者,猴DLL3結合。在一些實施方案中,在兩輪淘選后鑒定的親和力成熟的DLL3結合分子以約(minibodies)、納米抗體、肽抗體(peptibodies)或各種其他抗體模擬物(如affimers、[0242]在一些實施方案中,本文所述的DLL3靶向三特異性蛋白包含具有選自SEQID性抗原結合蛋白包含與選自SEQIDNo.1_442和1886的序列、其子序列及其變體具有至少異性抗原結合蛋白包含與選自SEQIDNo.(即,第三結構域(C))。在一些實施方案中,該三特異性抗原結合蛋白包含與選自SEQIDNo.1_442和1886的序列、其子序列及其變體具有至少70%_95%或更高同一性的DLL3結合[0243]本文所述的DLL3靶向三特異性蛋白被設計為允許通過募集細胞毒性T細胞來特異至靶細胞。本文所述的DLL3靶向三特異性蛋白經由與表面表達的CD3蛋白結合而接合細胞所述的DLL3靶向三特異性蛋白刺激細胞毒性T細胞殺死靶細胞以消除致病細胞(例如表達半衰期。這與具有相對短得多的消除半衰期的其他結合蛋白如BiTE或DART分子形成對照。例如,BiTECD19×CD3雙特異性scFv_scFv融合分子由于其消除半衰期短而需要連續的靜[0245]本文所述的DLL3靶向三特異性蛋白還具有對于增強的組織穿透和組織分布而言向三特異性蛋白通過具有允許增強的組織穿透和分布的小尺寸而避免了這一問題。因此,在一些實施方案中,本文所述的DLL3靶向三特異性蛋白的大小為約50kDa至約80kDa、約向三特異性蛋白的大小小于約60kDa。因此,所述DLL3靶向三特異性蛋白的大小優于約150kDa的IgG抗體以及約55kDa但半衰期沒有延長并因此快速通過腎臟清除的BiTE和DART通過已知方法如分選酶連接或綴合而附接至DLL3靶向三特異性蛋白上。在這些實例中,了將SME結合物附接至具有分選酶識別序列的DLL3三特異性抗原結合蛋白上,將該蛋白質[0248]本文所述的DLL3靶向三特異性蛋白的另一個特征是它們為具有其結構域的柔性體L1和L2連接,其中L1連接該DLL3靶向三特異性蛋白的第一和第二結構域,而L2連接該DLL3靶向三特異性蛋白的第二和第三結構域。連接體L1和L2具有優化的長度和/或氨基酸于連接DLL3靶向三特異性蛋白中結構域的內部連接體的實例包括但不限于(GS)n(SEQIDNo.1809)、(GGS)n(SEQIDNo.1810)、(GGGS)n(SEQIDNo.1811)、(GGSG)n(SEQID參見,PavelStrp,Veracityofmicrobialtransglutaminase,BioconjugateChem.25,包含烷基胺、草胺(oxoamine))與另一結構域綴合,其中綴合僅發生在抗原結合位點外部的DNA連接至編碼第一連接體部分的一端的DNA,并且編碼三個結構域中的第二結構域的接至第二連接體部分的一端,并且編碼三個結構域中的第三結構域的DNA連接至第二連接[0254]T細胞反應的特異性由TCR對抗原(在主要組織相容性復合物MHC的背景下展示)的[0256]在進一步的實施方案中,本文所述的DLL3靶向三特異性蛋白包含與TCR特異性結[0257]在某些實施方案中,本文所述的DLL3靶向三特異性蛋白的CD3結合域不僅表現出對于人CD3的有效的CD3結合親和力,而且還顯示出與各自的食蟹猴CD3蛋白的優異的交叉包含來自抗體或抗體片段的抗原結合域的人或人源化殘基域的輕鏈互補決定區1(LCCDR1)、輕鏈互補決定區2(LCCDR2)和輕鏈互補決定區3(LC輕鏈可變區,其中對CD3具有特異性的輕鏈可變區在人輕鏈框架區中包含人或非人輕鏈重鏈可變區,其中對CD3具有特異性的重鏈可變區在人重鏈框架區中包含人或非人重鏈[0263]在一個實施方案中,抗CD3結合域為包含本文提供的氨基酸序列的輕鏈和重鏈的飾或置換的序列,或至少約80%至約99%。CD3結合域的重鏈CDR2(HCCDR2)包含選自SEQ在選自SEQIDNo.1842_1853的序列中包含一個或多個修飾或置換的序列。CD3結合域的輕的序列中包含一個或多個修飾或置換的序列。CD3結合域的輕鏈CDR2(LCCDR2)包含選自區可以是例如以下方向中的任何一種:輕鏈可變區_scFv連接體_重鏈可變區或重鏈可變連接體將VH和VL區連接在一起來產生scFv分子。該scFv分子包含具有優化的長度和/或氨例如,包含甘氨酸和絲氨酸殘基的scFv連接體通常提供蛋白酶抗性。在一些實施方案中,No.1813)、(GGGGS)n)SEQIDNo.1814)、(GGGG[0266]與CD3結合的親和力可通過例如DLL3靶向三特異性抗原結合蛋白本身或其CD3結些研究證明了白蛋白結合與延長的作用之間存在[0272]DLL3靶向三特異性抗原結合蛋白的半衰期延長結構域導致DLL3靶向三特異性抗施方案中,半衰期延長結構域的重鏈CDR1(HCCDR1)包含選自SEQIDNo.1782_1784的序在選自SEQIDNo.1791或1792的序列中包含一個或多個修飾或置換的序列。[0276]DLL3(也稱為δ樣配體3或SCDO1)是NotchDSL配體的δ樣家族的成員。代表性的DLL3蛋白直向同源物包括但不限于人類(登錄號NP_058637和(結構域6)處,其中DSL結構域位于hDLL3的大約氨基酸殘基176_215處,N末端結構域位于合。兩種DLL3同種型均包含相同的胞外區,該區至少包含N末端結構域、DSL(Delta/結合域與DLL3的N末端結構域(成熟蛋白中的氨基酸27_175)結合或締合,而在其他實施方EGF4(氨基酸353_389)、EGF5(氨基酸391_427)或EGF6(氨基的免疫應答。在一些實施方案中,DLL3的衍生物包括序列上的變體,其中已對SEQID15個氨基酸,或基于蛋白質總長按氨基酸數目計最多20如最多10%或5%或1%)缺失、[0282]在一些實施方案中,所述DLL3結合域與包含SEQIDNo.1885(UniProtKB登錄包含SEQIDNo.1892或SEQIDNo.1893的序列(其為DLL3蛋白的成熟胞外域)的蛋白質結酸序列變體改善抗體的結合親和力和/或其他生物學性質。用于制備氨基酸變體的示例性或改善的T細胞介導的細胞毒性(TDCC)來篩選產物。保守和非保守的氨基酸置換均考慮用[0286]在一些實施方案中,所述DLL3靶向三特異性蛋白的DLL3結合域是單結構域抗體,(7)通過使用本領域已知的核酸合成技術制備編碼單結構域抗體的核酸,然后[0288]在一個實施方案中,單結構域抗體對應于針對DLL3的天然存在的重鏈抗體的VHH結構域。如本文進一步描述的,這樣的VHH序列通常可以通過以下方法來生成或獲得:用何合適技術從所述樣品開始生成針對DLL3的VHH序列。或半合成文庫,如通過諸如隨機誘變和/或CDR改組等技術從幼稚VHH文庫獲得的VHH文庫,[0290]在進一步的實施方案中,又一種獲得針對DLL3的VHH序列的技術涉及適當地免疫以使用表達重鏈抗體的大鼠或小鼠以及在WO02/085945和WO04/049794中描述的其他方處的一個或多個氨基酸殘基替換所述天然存在的VHH序列(特別是框架序列中)的氨基酸序因此不嚴格限于使用包含天然存在的VHH結構域的多肽作為起始材料獲得的多肽。在一些鏈抗體的VHH結構域中的相應位置處的一個或多個氨基酸殘基替換來自常規4鏈抗體的天形成VH_VL界面和/或存在于VH_VL界面處的氨基酸位置處以及/或者在所謂的駱駝科標志生成或設計駱駝化單結構域的起始材料或起始點的VH序列優選地是來自哺乳動物的VH序VHH結構域或VH結構域的氨基酸序列,分別設計本公開的期望的人源化或駱駝化抗DLL3單基于天然存在的VHH結構域或VH結構域的氨基酸序列或核苷酸序列,分別設計編碼本公開術從頭合成,之后使用已知的表達技術表達由此獲得的核酸,以提供本公開的期望的抗[0292]用于從天然存在的VH序列或VHH序列開始獲得本公開的抗DLL3單結構域抗體和/或編碼該抗BCMA單結構域抗體的核酸的其他合適方法和技術包括例如以合適的方式組合一個或多個天然存在的VH序列(諸如一個或多個框架(FR)序列和/或互補決定區(CDR)序列)的一個或多個部分、一個或多個天然存在的VHH序列(諸如一個或多個FR序列或CDR序結構域抗體或編碼該抗BCMA單結構域抗體的IDNo.1_442和1886的氨基酸序列。在一些實施方案中,所述DLL3結合域的CDR1包案中,所述CDR3包含選自SEQIDNo.1327_1768和1889的序列,或相對于選自SEQIDNo.1327_1768和1889的序列的一個或多個置自SEQIDNo.1379_1412的氨基酸序列,或在選自SEQIDNo.1379_1412的序列中具有一合域分別以食蟹猴Kd(cKd)和人Kd(hKd)與食蟹猴DLL3和人DLL3結合。在一些實施方案中,該DLL3結合蛋白以相當的結合親和力(即,hKd和cKd值相差不超過±10%)與人和食蟹猴在約0.001nM至約400nM的范圍內。在一些實施方案中,所述hKd和cKd在約0.001nM至約述hKd和cKd在約0.9nM至約4nM[0305]在某些實施方案中,本公開的DLL3結合域相對于可溶性DLL3優先結合膜結合的DLL3。膜結合的DLL3是指在表達DLL3的細胞的細胞膜表面之中或之上存在DLL3。可溶性確定抗原結合蛋白與膜結合的DLL3相對于可溶性DLL[0306]在一些實施方案中,任何前述DLL3結合域(例如,S[0307]在一些實施方案中,任何前述DLL3結合域(例如,S序列。[0311]在某些實施方案中,當施用于具有表達DLL3的腫瘤細胞的受試者時,本公開的原結合劑相比,本公開的三特異性蛋白的施用導致腫瘤細胞的體內生長減少約50_100%、性調節劑衍生物和包含一個或多個修飾的抗原個靶標結合位點可以特異性結合相同或不同的改變的糖基化模式或改變的碳水化合物組成的DLL3靶向三特異性結合蛋白。在一些情況對靶標的親和力或促進三特異性蛋白的產生。在需要降低效應物功能的某些實施方案中,含有編碼CD3結合域和半衰期延長結構域的基因。在半衰期延長結構域為小分子的實施方案中,多核苷酸含有編碼與CD3和DLL3結合的結構域的基因。根據所采用的載體系統和宿[0328]可利用多種表達載體/宿主系統,以包含并表達編碼所述三特異性抗原結合蛋白的多肽的多核苷酸。表達載體的實例是用于在大腸桿菌中表達的pSKK(LeGall等人,JImmunolMethods.(2004)285(1):111_27),或用于在哺乳動物細胞中表達的pcDNA5[0334]在一些實施方案中,本公開的DLL3靶向三特異性蛋白以至多10mg/kg的劑量以每或免疫特異性識別DLL3決定簇的T細胞)能夠有效地引發針對異常DLL3陽性細胞(包括癌癥或作為遵循標準醫護治療的維持方案的一部分施細胞活化域)連接的抗體的抗原結合域的人工構建的雜合蛋白質或多肽。在一些實施方案中,包含本公開的DLL3靶向三特異性結合蛋白的CAR具有通過利用抗體或其抗原結合片段CAR或DLL3致敏淋巴細胞或其任何組合有益地用于治療偽神經內分泌腫瘤和規范性神經內DLL3CAR或DLL3致敏淋巴細胞或其任何組合用于治療表達一種或多種標志物例如NSE、CD56+或PGP9.5+或ASCL1+或SYP+或CHGA+或其任何組合的腫巴細胞或其任何組合被用于維持治療中,以減少或消除疾病初次出現后腫瘤復發的機會。[0347]本公開的其他實施方案包括將DLL3結合蛋白、本公開的DLL3靶向三特異性蛋白、DLL3CAR或DLL3致敏的淋巴細胞或其任何組合施用于無癥狀但有發展成增生性疾病風險的受試者。即,在一些實施方案中,DLL3結合蛋白、本公開的DLL3靶向三特異性蛋白、DLL3CAR或DLL3致敏的淋巴細胞或其任何組合以預防性意義使用,并提供給已經過檢查或察或通過公認的臨床實踐來確定有效的給藥公開的各個實施方案(包括本公開的藥物組合物和劑型和試劑盒)中使用的抗癌劑的非限管生成抑制劑;拮抗劑D;拮抗劑G;安雷利克斯;抗背側化形態發生蛋白_1(anti_夫拉平度;氟卓斯汀;fluasterone;氟達拉濱;鹽酸氟道諾霉素(fluorodaunorunicinhydrochloride);福酚美克;福美坦;福司曲星;福莫司汀;德卟啉釓(gadolinium酰胺;羅谷亞胺;羅希吐堿;羅莫肽;羅喹美克;rubiginoneB1;ruboxyl;沙芬戈;抑制劑;stipiamide;溶基質蛋白酶抑制劑;sulfinosine;強效血管活性腸肽拮抗劑;替尼泊苷;四氯十氧化物(tetrach新;胸腺生成素受體激動劑;胸腺曲南;促甲狀腺激素;本紫紅素乙酯錫(tinethyl[0351]根據本公開的另一個實施方案,提供了用于在體外或體內檢測DLL3表達的試劑單結構域抗體或其抗原結合片段的三特異性蛋白),以及一種或多種用于檢測標記物的化結構域抗體或抗DLL3三特異性蛋白接觸并檢測該單結構域抗體與樣品的結合來確定受試與本文公開的抗DLL3單結構域抗體或抗DLL3三特異性蛋白接觸并檢測該抗體與樣品的結或抗DLL3三特異性蛋白特異性結合的第二抗體與所述樣品接觸;以及檢測第二抗體的結酶或乙酰膽堿酯酶。合適的輔基復合物的非限制性實例包括鏈霉親和素/生物素和抗生物些測定中使用。因此,這些抗體可以用于常規的免疫測定中,包括但不限于ELISA、RIA、[0365]用在EXPI293TM細胞中表達的純化的DLL3蛋白免疫美洲駝。從循環表達重鏈可變抗體結構域的噬菌體展示文庫(參見vanderLinden,deGeus,Stok,Bos,vanWassenaar,Verrips,andFrenken.2000.JImmunolMethods240:185_195)。通過在[0367]將三十四種(SEQIDNo.53至86)來自實施例1的示例性美洲駝抗DLL3僅重鏈單結[0368]將人源化的抗DLL3序列克隆到表達載體中的表達載體中抗人CD3抗體2B2(SEQIDNo.1793),隨后是HHHHHH標簽(SEQIDNo.1[0369]然后將包含人源化抗DLL3結合序列的抗DLL3三特異性構建體轉染入EXPI293TM細尖端的Octet儀器對轉染的EXPI293TM細胞在條件培養基中抗DLL3三特異性構建體的量進行[0370]使用含有已知濃度的抗DLL3三特異性蛋白的條件培養基,使用以下方法測量抗[0371]還通過T細胞依賴性細胞毒性測定對條件培養基進行了檢測(參見NazarianAA,ArchibequeIL,NguyenYH,WangP,SinclairAM,PowersDA.2015.JBiomolScreen.20:519_27)。在該測定中,將螢光素酶標記的DMS_153細胞(小細胞肺癌細胞系;ATCCNo.實驗開始后48小時進行螢光素酶測定所確定的DMS[0373]圖2_6顯示了代表性TDCC數據的圖,幾種示例性抗DLL3三特異性蛋白能夠降低(SEQIDNo.58)的DLL3三特異性蛋白的TDCC測定結果。圖5顯示了針對包含DLL3結合域的DLL3三特異性蛋白的TDCC測定結果。圖6顯示了包含DLL3結合域DH58(SEQIDNo.74)和DH70(SEQIDNo.79)的DLL3三特異性蛋白的TDCC測定結果。TDCC測定的陰性對照是靶向DLL3蛋白的親和力。使用單一濃度的抗DLL3三特異性蛋白進行KD測量。使用人T細胞進行[0378]實施例3:使用兩種來自先前實施例的人源化DLL3單結構域抗體對噬菌體展示文[0379]使用兩種人源化抗體序列DH43(SEQIDNo.68)和DH6(SEQIDNo.75)作為制備噬菌體展示選擇后在DH43DLL3結合物序列中獲得的CDR變化。從淘選中鑒定出的三個克隆,IDNo.227(2E05_M106Y)、2(4H11_M34L)是SEQIDNo.365(4H011)的工程變體。通過淘選鑒定的這些DLL3結合克隆的CDR1序列為SEQIDNo.529至809,通過淘選鑒定的克隆的CDR2序列為SEQIDNo.971至[0385]對于在這一輪淘選中確定的特定DLL3結合物分子以及親本DLL3結合物DH43和DLL3結合分子的更精確測量確定的結合親和力列于表4中[1H012(SEQIDNo.162);1A011[0386]使用與實施例2中所述相同的方案,選擇在這一輪淘選中鑒定出的22個DLL3結合物分子用于在采用DMS_153細胞的TDCC測定中進行測試。示例性的TDCC數據在圖7_11中以對照的靶向GFP的對照三特異性蛋白在該使用單一濃度的抗DLL3三特異性蛋白確定的食對蟹猴[0396]將實施例3中所述的抗DLL3三特異性蛋白以及親本DLL3結合分子亞克隆到CHO細的方法在TDCC測定中測試純化的蛋白質。并且數據的圖示在圖12_15中給出。最有效的分41nM,是其親本分子DH43的6.6倍。衍生自DH6的最有效的分子是4D09_M34L(SEQID[0400]為了獲得更有效的抗DLL3結合物,進行了第二輪親和力成熟。基于DH6(SEQID序列為SEQIDNo.810至884,在這輪親和力成熟中鑒定出的DLL3結合物的CDR2序列為SEQIDNo.1252_1326,而在這一輪親和力成熟中鑒定出的DLL3結合物的CDR3序列為SEQID是抗人CD3抗體2B2(SEQIDNo.1793),隨后是HHHHHH標簽(SEQIDNo[0402]然后將含有親和力成熟的抗DLL3結合序列的抗DLL3三特異性構建體轉染入用帶有蛋白A尖端的Octet儀器對轉染的EXPI293TM細胞的條件培養基中抗DLL3三特異性構[0404]還通過T細胞依賴性細胞毒性測定對條件培養基進行了檢測(參見NazarianAA,ArchibequeIL,NguyenYH,WangP,SinclairAM,PowersDA.2015.JBiomolScreen.20:特異性蛋白合并。假設如果抗DLL3三特異性蛋白引導T細胞殺死表達DLL3的DMS_153細胞,則通過在實驗開始后48小時進行螢光素酶測定所確定的DMS_153細胞的活力應該降低。圖16示出了含有以下DLL3結合域的抗DLL3三特異性蛋白的代表性TDCC數據的圖:51A02(SEQ[0418]將某些含有在實施例5中所述測定中具有最強TDCC活性的DLL_3結合序列的抗DLL3三特異性蛋白和含有親本DLL3結合物DH6的抗DLL3三特異性蛋白亞克隆到CHO細胞表[0420]使用與實施例2中描述的相同方法在TDCC測定中測試純化的蛋白質,不同之處在[0421]表10:純化的CHO表達的親和力成熟的抗DLL3三特異性蛋白在體外對人和獼猴[0424]在T細胞依賴性細胞毒性(TDCC)測定(參見NazarianAA,ArchibequeIL,NguyenYH,WangP,SinclairAM,PowersDA.2015.JBiomolScreen.20:519_27)中測試了幾種包圖21所示以抗CD3:抗ALB:抗DLL3(CAT)構型包含DLL3結合23)、SHP77(圖24)或WM2664(圖25)細胞與純化的人T細胞和的活力應該降低。圖22示出了使用NCI_H2171細胞對以TAC或CAT構型包含以下DLL3結合域的DLL3結合三特異性蛋白的代表性TDCC數據的圖。圖23示出了使用DMS_79細胞對以TAC或CAT構型以下DLL3結合域的的DLL3結合三特異性蛋白的代表性TDCC數據的圖。圖24示出了使用SHP77細胞對以TAC或CAT構型包含以下DLL3結合域的DLL3結合三特異性蛋白的代表性抗DLL3:抗ALB:抗CD3(TAC)構型(SEQIDNo.1891;或抗CD3:抗ALB:抗DLL3(CAT)構型(SEQIDNo.1890))的情況下孵育。人T細胞進一步與同AlexaFluor647綴合的第二抗體(抗三與示例性三特異性蛋白或第二抗體孵育的細胞(圖26中圖形中抗CD3(TAC)構型的示例性DLL3三特異性蛋白的存在下觀察到抗三特異性抗體的牢固結合白或第二抗體孵育的細胞(圖27中圖形中的左峰),在抗CD3:抗例性DLL3三特異性蛋白的存在下也觀察到抗三特異性抗體的牢固結合(圖27中圖形中的右靶向GFP的對照三特異性分子一起孵育的細胞(圖28中圖形中的左峰),觀察到DLL3靶向三GFP的對照三特異性分子一起孵育的細胞(圖29中圖形中的左峰),觀察到DLL3靶向三特異三特異性抗體結合到與示例性DLL3靶向三特異性蛋白或靶向GFP的對照三特異性分子(數據未示出)一起孵育的細胞上,表明示例性DLL3靶向三特異性分子不與缺乏DLL3表達的細[0431]實施例10:示例性DLL3靶向三特異性蛋白引導T細胞介導的對表達DLL3的癌細胞[0432]這項研究的目的是評估示例性DLL3靶向三特異性分子是否能夠引導T細胞殺死表(以TAC和CAT構型兩者)能夠有效地引導來自所有四名健康供體的T細胞殺死所有四種表達了進一步的TDCC測定。觀察到靶向DLL3的TriTAC不能引導T細胞殺死這兩種缺乏DLL3表達用以抗DLL3:抗ALB:抗CD3(TAC)構型包含本公開的DLL3結合域52D04的示例性DLL3靶向三用以抗CD3:抗ALB:抗DLL3(CAT)構型包含本公開的DLL3結合域52D04的示例性DLL3靶向三IDNo.1891)在37℃下孵育48小時。來自相同供體的T細胞也在37℃下與靶向GFP的對照三[0441]實施例12:由示例性DLL3靶向三特異性蛋白誘導的T細胞產生的DLL3依賴性細胞[0442]在該測定中,將來自健康供體的T細胞和NCI_H82或SHP77細胞與示例性DLL3靶向時。來自同一供體的T細胞也在37℃下與靶向GFP的對照三特異性分子GFPTriTAC和NCI_H82或DMS53細胞一起孵育48小時。48小時后,收集條件培養基,并使用電化學發光測定γ的產生在圖46和47中示出;IL_2的產生在第6天開始到第28天結束每隔幾天測量一次腫瘤體積。與以100μg/kg劑量給予靶向GFP的[0450]當以0.3mg/kg給藥時,DLL3分子水平的血清水平的圖。然后將數據用于計算DLL3靶向三特異性分子的藥代動力學性[0454]當以1或10mg/kg給藥時,DLL3靶向三特異[0455]對于本研究,向食蟹猴靜脈內注射1mg/kg或10mg/kg劑量的示例性DLL3靶向三特了在不同時間點DLL3靶向三特異性分子水平的血清水平的圖。然后將數據用于計算該[0458]當以最高10mg/kg的單次劑量給予時,示例性DLL3靶向三特異性蛋白在食蟹猴中[0459]觀察到血清細胞因子水平的短暫增加,主要是在以10mg/kg的劑量施用示例性DLL3靶向TriTAC進行比較。對于血清樣品和新鮮融化的蛋白觀察到相同的細胞DMS53細胞殺傷(圖64),表明DLL3靶向TriTAC在食蟹猴給藥1周后保留了引導T細胞殺死靶細胞的能性抗原結合蛋白(抗DLL3三特異性蛋白)施用于神經內分泌癌癥患者的概念驗證臨床試驗[0465]這是用于研究示例性DLL3三特異性抗原結合蛋白作為神經內分泌癌癥治療的I/[0473]1.3目標是確定示例性抗DLL3三特異性蛋[0476]II期的主要結果確定采用示例性DLL3靶向三特異性蛋白的療法是否會致使至少20%的患者實現臨床反應(強烈反應(blastresponse)、輕微反應、部分反應或完全反[0562]MVSPRMSGLLSQTVILALIFLPQTRPAGVFELQIHSFGPGPGPGAPRSPCSARLPCRLFFRVCLKPGLSEEAAESPCALGAALSARGPVYTEQPGAPAPDLPLPDGLLQVPFRDAWPGTFSFIIETWREELGDQIGGPAWSLLARVAGRRRLAAGGPWARDIQRAGAWELRFSYRARCEPPAVGTACTRLCRPRSAPSRCGPGLRPCAPLEDECEAPLVCRAGCSPEHGFCEQPGECRCLEGWTGPLCTVPVSTSSCLSPRGPSSATTGCLVPGPGPCDGNPCANGGSCSETPRSFECTCPRGFYGLRCEVSGVTCADGPCFNGGLCVGGADPDSAYICHCPPGFQGSNCEKRVDRCSLQPCRNGGLCLDLGHALRCRCRAGFAGPRCEHDLDDCAGRACANGGTCVEGGGAHRCSCALGFGGRDCRERADPCAARPCAHGGRCYAHFSGLVCACAPGYMGARCEFPVHPDGAS

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