2024年抗體類藥物FTO報告撰寫操作手冊-智慧芽

智慧芽抗體類藥物FTO報告撰寫操作手冊●智慧芽生物醫藥2024年10月智慧芽生物醫藥作為行業的創新先鋒，精心構建了由Synapse新藥情報庫、Bio生物序列數據庫、Chemical化學結構數據庫和Hiro-LS芽仔生物醫藥四大核心產品組成的綜合SaaS產品矩陣，同時提供數據服務串聯各維度數據，組成綜合數據服務平臺。這一平臺旨在為生物醫藥領域的全產業鏈條提供全面、精確、實時且遵循統一標準的全生命周期數據服務，以支持行業內的科研、開發、生產和商業決策。通過運用前沿的大數據和人工智能技術，結合生物醫藥領域專家的深入洞察和嚴格審核，智慧芽生物醫藥實現了對產業鏈數據的高效集成和精準處理。我們的生物醫藥產品系列已經建立了一個全球范圍內的實時數據更新機制，能夠從廣泛的網絡資源中提取關鍵的原始數據，確保為生物醫藥行業的各個環節提供全面、深入的數據支持和解決方案。本報告由智慧芽生物醫藥提供，旨在為抗體藥物FTO報告的撰寫提供指導和參考。本報告由撰寫者基于當前可獲得的數據和信息編制，并不保證所包含信息的完整性、準確性或最新性。本報告中的分析、預測、建議或其他內容僅代表作者或相關專家的觀點，并不構成法律、商業或任何其他形式的專業建議，故僅供參考。如由此引發的商業損失，本報告將不承擔任何責任。報告意見反饋：cuimeili@新藥情報庫新藥情報庫√篩選投資標的點擊此處試用化學結構數據庫化學結構數據庫點擊此處試用生物序列數據庫點擊此處試用第1章抗體藥物FTO報告概述1.2抗體藥物FTO報告的意義第2章抗體藥物介紹2.2.2多抗2.2.3抗體偶聯藥物(Antibody-DrugConjug第4章抗體藥物FTO的專利檢索分析策略第5章抗體藥物FTO專利檢索分析中的部分注意事項第6章抗體藥物FTO報告中的總結建議部分第7章抗體藥物FTO報告中的附錄部分7.3免責聲明第1章抗體藥物FTO報告概述FTO(FreedomtoOperate,專利自由實施)報告是對特定技術或產品在特定市場范圍內自由實施而不侵犯他人知識產權的分析評估報告。在抗體藥物領域，FTO報告主要包括以下內容：(1)專利檢索：對與抗體藥物相關的專利進行全面檢索，包括已授權專利、正在審查的專利申請以及潛在的專利。(2)專利分析：對檢索到的專利進行詳細分析，確定其權利要求范圍、有效性和可實施(3)侵權風險評估：評估抗體藥物技術或產品是否可能侵犯他人的專利，確定侵權風險的大小。(4)建議措施：根據侵權風險評估結果，提出相應的建議措施，如調整技術方案、尋求專利許可或進行專利無效挑戰等。1.2抗體藥物FTO報告的意義FTO報告不但是知識產權工作的頂層設計，而且還是企業產略決策的重要組成部份，主要的意義包括：(1)降低法律風險抗體藥物研發和生產過程中，一旦侵犯他人的專利，不但可能面臨高額的賠償和法律訴訟，更嚴重的是會面臨抗體藥物無法上市的局面。FTO報告可以幫助企業提前發現潛在的侵權風險，采取有效的規避措施，降低法律風險。重要的是，能夠避免故意侵權及懲罰性賠償。在美國、歐洲等地的專利制度中均有關于懲罰性賠償的規定，我國新修訂的《專利法》也引入了1～5倍的侵權懲罰性賠償條款，凸顯出各國對于遏制故意侵權、強化知識產權保護的決心。企業若能提前進行FTO分析，并將報告作為抗辯惡意侵權的重要證據，可在一定程度上減輕或消除“故意”要件，從而降低或免除懲罰性賠償責任。(2)指導研發決策智慧芽(3)促進商業合作在商業合作中，FTO報告可以增強合作方的信心，降低合作風險。一(4)提升企業競爭力擁有良好的知識產權保護體系和FTO報告，可以提升企業在市場中的競爭力。企業可以隨著生物技術的不斷發展，抗體藥物在醫療領域的應用越來越廣泛。然而，抗體藥物的研發和生產涉及復雜的技術和大量的資金投入，知識產權保護成為至關重要的問題。FTO報制備的藥物，具有特異性高、性質均一、可針對特定靶點定向制備等優點，在各種疾病治療，特別是腫瘤治療領域的應用前景備受關注。類型進行區分。在47~62之間；(不同抗體可能有所不同);抗體的主體結構示意圖如下：抗體的4個亞型的結構示意圖如下圖：32.2抗體藥物類型的簡介特點：由單一克隆的B細胞產生，具有高度的特異性和均一性。作用機制：通過與靶抗原特異性結合，發揮多種生物學功能，如中和毒素、阻斷受體信作用機制：抗體部分特異性結合靶細胞表面抗原，將細胞毒性抗體藥物在醫學領域具有廣泛的應用，涉及腫瘤治療、自身免疫性疾病治療、感染性疾在腫瘤治療方面，抗體藥物已成為一種常見且重要的治療手段。一些抗體藥物能夠識別智慧芽腫瘤細胞表面的抗原，通過與腫瘤細胞結合，觸發免疫系統的攻擊，進而殺死腫瘤細胞。此外，抗體藥物還可以與化療藥物或放射性核素結合，通過抗體介導的靶向作用，提高藥物的療效和減少副作用。很多抗體藥物已經獲得了美國食品藥品監督管理局(FDA)的批準，用于治療不同類型的腫瘤，如乳腺癌、肺癌、結腸癌等。自身免疫性疾病治療方面，抗體藥物也發揮了重要作用。自身免疫性疾病是由于免疫系統異常攻擊自身組織而引起的疾病，如類風濕性關節炎、系統性紅斑狼瘡、干燥綜合征、特應性皮炎等。一些抗體藥物可以通過抑制免疫細胞的活性或調節免疫系統的反應，來控制疾病的進展和緩解癥狀。例如，有”藥王“之稱的阿達木單抗就是一款針對腫瘤壞死因子 (TNF-α)的抗體藥物，被批準用于治療類風濕性關節炎和強直性脊柱炎。在感染性疾病治療方面，抗體藥物可以用于預防和治療病毒、細菌和寄生蟲等感染。一些抗體藥物能夠識別病原體表面的抗原，阻止病原體與宿主細胞的結合，從而抑制感染的傳播。例如，一些針對流感病毒、艾滋病病毒和冠狀病毒的抗體藥物已經在臨床試驗中顯示出一定的療效。在神經系統疾病治療方面，抗體藥物可用于治療一些神經退行性疾病，如帕金森病、阿爾茨海默病等。這些疾病是由于神經元死亡或功能障礙而引起的。一些抗體藥物可以識別并清除神經元內的有害物質，如β-淀粉樣蛋白、tau蛋白等，從而保護神經元免受損傷。從1975年開始治療性抗體及其應用的開發時間表如下圖。0第0第Atezolizumab(Tecentric)arb-PDL1foReslizmab(Cingsero,Cinqu)aL-5toraart-PD4L1forbladderc,YeartostofantiDaclizumab(Zinar6-CD25tormuhplosd(Avatiny:aVEGFforОAdaimumab(Humiaar-TNFaborRA401目前市面上的檢索工具很多，知名的有智慧芽、incopat、佰騰網、國家知識產權局官方專利檢索數據庫、藥智網等。由于智慧芽擁有Bio序列數據庫的優勢，能夠進行抗體類數據的檢索和比較，藥物基因索引等，且能夠通過智慧芽新藥情報庫進行補充專利檢索，故本報告采用智慧芽數據庫進行檢索。 短序列搜索選項高級設置>0□專利⑨全部受理局0Ⅲ"比對報告三關閉側欄□非專利庫常規G00003.2檢索目的和范圍的確定檢索的目的決定了FTO報告的檢索范圍，通常來說，抗體藥物的檢索范圍從以下幾個方面進行確定：1、地域性：由于抗體藥物的售賣具有地域性，所以可以錨定特定國家內的專利，但是需要提前對售賣國家的專利制度進行充分的了解，以歐洲為例，歐洲專利局(EPO)是依據歐洲專利公約而設立的機構，其覆蓋范圍十分廣泛，涵蓋了39個締約國、4個生效國以及延伸國波黑。就法國而言，申請人能夠向法國專利局提交申請，從而獲取帶有FR代碼的國家專利；同時，也可以選擇向歐洲專利局提交申請，在經審查授權后可獲得EP代碼的歐洲專利，并且該專利在法國境內登記后生效。在這種情況下，EP專利與FR國家專利在法國國內都享有同等智慧芽的法律效力。所以，當對參與歐洲專利公約的44個國家進行潛在侵權風險的專利檢索時，除了要全面檢索各個國家的國家專利之外，還2、授權專利保護時間期限：以發明專利20年的期限為標準，同時考慮特定目標檢索國家的藥物專利補償時間，在全球多個不同的司法管轄區，像美國、日本、韓國、澳大利亞、俄羅斯以及中國等國家，都實行了專利權期限補償制度。這種制度使得某些發明專利的實際保護期限有機會延長到大約20至25年。4、PCT申請空窗期：PCT申請存在一個特殊的情況，有一個被稱為“空窗期”的階段。這個空窗期并非通常所說的18個月公開期。具體表現為當PCT申請在專利數據庫中超過30到32個月時，會被標記為“已過指定期，失效”。然而，即使處于這種狀態，如果該申請要進入國家階段，還會經歷一段時間才會公布，這個過程通常是6個月 (世界知識產權組織)的檢索結果篩選時，如果直接以有效性進行篩選，就會把那些過了指第4章抗體藥物FTO的專利檢索分析策略由于單抗藥物僅有一個靶點，抗體結構相對簡單，可以通過序列為主，進行專利檢索，同時對于競品企業應當全面檢索其專利申請情況，以防止漏檢。本文以傳統的“Y”字型單抗結構舉例，具體的專利檢索分析策略如下：索活性成分1.4鉸鏈區序列索文件1查文件1查列/-1.5恒定區序列一析索目目報告總結與未施建議對專利保相同技文件4單抗藥專利檢索策略8、表達載體專利專利84.2多抗藥物FTO的專利檢索分析策略由于多抗藥物有多個靶點，抗體結構相對復雜，可以通過序列為主，分別對不同的靶點結構域進行專利檢索，同時對抗體結構描述構建檢索式，并且對于競品企業應當全面檢索其多抗藥物FTO專利檢索策略析索目圍序列—主要檢索索通過智通過智索索索+構建件去噪地域性、期限等條件去噪查間中命間中命一并合并一工作空間中命→抗結構風險專相同技術方案一并合并一相同技物配方/制劑分析/風險專利分析和比對議9智慧芽生物醫藥/life-scienceADC藥物的結構包括抗體、毒素化合物和連接子，應主要檢索補充檢索檢索非常規鉸補充檢索檢索非常規鉸或者特定索通過智據庫進檢索通過智據庫進檢索L鏈序列并合并一術方案地域性、有效性、專利保護一件去噪序列利用智利用智通過智數據庫進行序列檢索并合并地域性、有效性、文件1間中命文件2文件3保存在智慧芽工作空析→列風險術方案術方案并合并一術方案地域性、有效性、當連接子為化合物時索索ADC藥析3、連接子地域性、有效性、專利保護專利保護一文件4分析文件4分析物配方/制劑地域性、有效性、專利保護索bio數據庫+構建檢索式數據庫圍告總結與未來議險專利FTO專利檢索策略地域性、有效性、地域性、有效性、8、聯合用藥9、用途地域性、有效性、專利保護地域性、有效性、專利保護選選6中的企業所有—1、用IPC分類號限定去噪智慧芽第5章抗體藥物FTO專利檢索分析中的部分注意事項在如上文第4章描述的抗體藥物FTO的專利檢索分析策略中，包括以下注意事項需要提醒：1、在待檢索單抗/多抗/ADC等抗體藥物技術解析步驟中，可采用智慧芽新藥情報庫輔助技術解析，例如，通過在新藥情報庫中檢索替雷利珠單抗藥物：概要研發狀態藥物交易專利臨床分析臨CVoLOE8GPGLVKPSETLBLTCTVSGFSLTsYGVEWIRQPPGKGLEWIGVIYAD61PSIKSRVTISRDTSNOVSLRLSSVTAADTAVYYCAEArosYWYIDViaoGTTVTVSsA121TKGPSVFPLAPCSRSTSESTAALGCLVKDYFPEPVTVsNsGALTSGVHTPP181Y部L8SVVTVPs88LGTKTYTCIVDHKPSNTKVDERVESKYGPPCPPCPAPP241FPPKPKDTLMISRTPEVTCVvVAVSQEDPEVQENMWYVDGVEVHNAETEPREEQENST301VSVLTVVHODWLNGKEYKCRVSNKGLPSSTEKTISKAKGOPREPOVYTLPPSQEENT心專利從上圖我們可以獲得包括以下內容：a、可通過獲得包括抗體藥物序列、化合物、核心專利等信息了解產品的技術內容，幫助我們更好的解析和分解抗體藥物的技術；b、可通過獲得抗體藥物的交易信息了解抗體藥物的合作伙伴，以便用于后續排除侵權可能性；C、可通過獲得抗體藥物的臨床試驗信息，了解抗體藥物可能的市場化的應用，幫助我們做侵權判定分析。2、在序號為1的抗體序列本身檢索中，序號1.1的CDR序列檢索是抗體藥物活性成份的主要檢索之一。需要注意的是，如權利要求單獨保護一個或多個CDR,且說明書中未出現同時滿足CDR1、CDR2、CDR3的可變區/全長序列，這樣的專利往往會被漏檢，或者數據庫不會作為高相關專利顯示。在對檢索結果進行分析時，需要分別篩選出匹配1個或2個或3個CDR的專利，并對涉及保護CDR的權利要求進行侵權判定分析，智慧芽bio序列數據庫能夠顯示分別匹配1個或2個或3個CDR的專利，且提供了文獻和其它來源命中序列信息，供FTO制作者根據情況多維度的檢索，如下圖所示。根據設置的參數(重鏈和輕鏈用戶可自定義，CDRs為默認值),逐條檢索查詢序列，并展示命中序列數量以及其公開源數量狀況。(檢索范圍：抗體庫，如需全庫檢索，■■■■■不同的標注方式，例如IMGT、Chothia、Kabat、Martin規則下的CDR序列各不相同，不建議針對不同標注方式的CDR序列分別進行多次檢索，因為這樣會增加較多分析的工作量。因此，筆者建議針對VH和VL以及H和L進行檢索，一般建議在VH和VL設置80%以上的序列相似a、作為CDR檢索的重要互補檢索策略，VH和VL可有效檢出全長符合80%以上相似度，1及其同一性在80%以上序列”,這種情況未限定CDR,權利要求保護范圍也比較大，如不C、由于H鏈和L鏈基本是抗體藥物的最小保護范圍，且前面進行了CDR等全面檢索，所可通過NCBI提供的登錄號判斷，登錄號靠后表示越新。同時，NIH提供了確定序列更改的記錄服務，專門用于專利目的，可在序列登錄號的鏈接后加“?=report=girevhist”來NIH》aonwConterbyBsocrobBLASTndrosonododoboeblastxaurd5、在抗體藥物FTO中，還應對結合靶點專門構建檢索式進行檢索，因為一些在審專利申請的權利要求會以靶點、適應癥等角度保護抗體，但未限定具體的序列。這類專利申請的權利要求保護范圍較大，并且目標抗體很有可能會落入保護范圍。一般認為，這類專利權利要求中限定的抗體需要得到說明書中具體序列的支持，并且直接授權的前景很小。但依據FTO報告全面性的原則，此類專利不應該被漏檢。6、在抗體藥物制備過程中，抗體平臺和相應基因編輯技術，均應根據技術特點，對可能的技術風險點構建檢索式，通過智慧芽專利數據庫檢索，推薦專家檢索或高級檢索功能。尤其注意CRISPR/Cas9的專利之爭要迎來最后的審定，是否可能涉及基因編輯相關技術的侵權需要特別注意。7、針對抗體藥物申請專利的特點，還需要對藥物配方/制劑、聯合用藥，用途和表達載體進行檢索，完善FTO報告的全面性。8、對保存在工作空間內的所有相關專利進行分析時，應同時進行簡單的同族拓展，在同一家族中確定保護范圍最大的專利，以防關鍵專利被遺漏。9、在序號二的競品企業所有專利檢索部份，針對競品企業的擴展搜索可以從公司名稱、控股公司、子公司、股東、董事長等工商信息入手，并結合對手核心專利的主要發明人、技術轉讓方、許可方等信息進行關聯挖掘。10、單個國家申請的檢索按照單個國家進行檢索，而對WIPO的檢索也可單獨進行，并且可以以優先權日(3年)的對象來進行檢索。11、在篩選前，要了解各個國家或地區的專利過期日計算方式后，再做判斷。例如美國智慧芽藥品專利申請，存在兩種藥品延長制度(PTA+PTE),具體的專利到期日可通過橙皮書或12、專利篩選可通過兩個階段進行，初篩階段排除法，即將明顯不相關的專利排除掉，相關性存疑的專利全部保留，此時可不考慮專利的保護范圍和版本。在精篩階段，將初篩列表中的權利要求所保護的技術方案與技術事實作初不侵權(通常而言)③更為具體下位的技術特征(例如C為金屬、c為銅)特別針對全面覆蓋原則下的特殊情況——待分析方案不僅涵蓋了專利權利要求中的全部技術特征，還額外添加了新的技術特征，如情形②。在這種情況下，通常仍會被視為落入專利權的保護范圍之內。然而，必須注意的是，如果專利權利要求的文字表述已經明確排除了新增技術特征的存在，那么即使待分析方案包含了這些新增特征，也不能視其為侵犯專利權。例如，在封閉式組合物權利要求的情形下，若待分析方案相較于原有權利要求多出了特征D,按照常規理解，這將不構成侵權。但是，例外情況在于：新增特征D若未實質性改變組合物的性質和技術效果，或是屬于無法避免的常規數量雜質時，則不應被認定為超出專第6章抗體藥物FTO報告中的總結建議部分在FTO的總結建議部分，應當包括以下內容：1.整體自由實施風險等級評定：對有效專利和在審查中的專利進行區分并進行風險評級，給出整體實施風險等級的評定。2.應對策略建議：對有效專利的策略包括專利無效請求、訴訟、合作、技術規避涉和等待專利過期等。對在審查中的專利的策略包括提第三方意見等方式阻止其授權或縮小保護范3.跟蹤建議：需就FTO報告的結論給出未來的跟蹤建議。4.專利布局建議：就檢索抗體藥物的未來專利布局給出包括技術、時間和區域的建議。第7章抗體藥物FTO報告中的附錄部分在FTO報告的附錄部份，通常需要包括司法條款，主要條款如下：A.《專利法》第五十九條發明或者實用新型專利權的保護范圍以其權利要求的內容為準，說明書及附圖可以用于解釋權利要求的內容。B.《最高人民法院關于審理專利糾紛案件適用法律問題的若干規定》第十七條專利法第五十九條第一款所稱的“發明或者實用新型專利權的保護范圍以其權利要求的內容為準，說明書及附圖可以用于解釋權利要求的內容”,是指專利權的保護范圍應當以權利要求記載的全部技術特征所確定的范圍為準，也包括與該技術特征相等同的特征所確定的范圍。等同特征，是指與所記載的技術特征以基本相同的手段，實現基本相同的功能，達到基本相同的效果，并且本領域普通技術人員在被訴侵權行為發生時無需經過創造性勞動就能夠聯想到的特征。C.北京市高級人民法院《專利侵權判定指南(2017)》發明、實用新型專利權的侵權判定：全面覆蓋原則。全面覆蓋原則是判斷一項技術方案是否侵犯發明或者實用新型專利權的基本原則。具體含義是指，在判定被訴侵權技術方案是否落入專利權的保護范圍，應當審查權利人主張的權利要求所記載的全部技術特征，并以權利要求中記